La filial de Córdoba inició sus actividades en el año 2000 con la inauguración de la Aldea en el barrio Argüello, en las afueras de la ciudad de Córdoba.
En 2015, la filial reubicó el Programa de Cuidado Alternativo. Actualmente, cuenta con casas en el barrio preparadas para brindar atención y acompañamiento a niñas, niños y adolescentes en un entorno seguro, protector y afectivo.
En abril de 2022 se inauguró el Espacio de Cuidado Diario Lima Limón, donde se brinda acompañamiento integral a niñas y niños a través de propuestas vinculadas a la alimentación, el apoyo educativo, el seguimiento de salud, la recreación y el cuidado de calidad. La filial también cuenta con un Centro de Innovación Tecnológica (CIT), el programa de Adolescentes y Jóvenes (Casa de Pre-Egreso y Acompañamiento a la Independencia), Desarrollo de Capacidades de equipos, Incidencia Pública y Empleabilidad.
Aldeas Infantiles SOS Córdoba en números (promedio anual 2025):